| 和名・学名 | 
科 目 | 
愛媛県カテゴリー | 
| ヤクシマアカシュスラン Hetaeria yakusimensis (Masam.) Masam.  | 
ラン科  | 
絶滅危惧1A類(CR) | 
| ヤクシマヒメアリドオシラン Vexillabium yakushimense (Yamam.) F.Maek.  | 
ラン科  | 
絶滅危惧1A類(CR) | 
| ヤシャビシャク Ribes ambiguum Maxim.  | 
ユキノシタ科(APG:スグリ科)  | 
絶滅危惧1B類(EN) | 
| ヤチカワズスゲ Carex omiana Franch. et Sav.  var. omiana  | 
カヤツリグサ科  | 
絶滅危惧1B類(EN) | 
| ヤチマタイカリソウ Epimedium grandiflorum C.Morren  var. grandiflorum  | 
メギ科  | 
準絶滅危惧(NT) | 
| ヤナギアザミ Cirsium lineare (Thunb.) Sch.Bip.  | 
キク科  | 
絶滅危惧1A類(CR) | 
| ヤナギイノコヅチ Achyranthes longifolia  (Makino) Makino  | 
ヒユ科  | 
情報不足(DD) | 
| ヤナギスブタ Blyxa japonica (Miq.) Maxim. ex Asch. et Gürke  | 
トチカガミ科  | 
絶滅危惧1A類(CR) | 
| ヤナギタンポポ Hieracium umbellatum L.   | 
キク科  | 
絶滅危惧1B類(EN) | 
| ヤナギヌカボ Persicaria foliosa (H.Lindb.) Kitag.  var. paludicola (Makino) H.Hara  | 
タデ科  | 
絶滅危惧1A類(CR) | 
| ヤマアザミ Cirsium spicatum (Maxim.) Matsum.   | 
キク科  | 
情報不足(DD) | 
| ヤマアゼスゲ Carex heterolepis Bunge  | 
カヤツリグサ科  | 
絶滅危惧1B類(EN) | 
| ヤマアワ Calamagrostis epigeios (L.) Roth  | 
イネ科  | 
絶滅危惧2類(VU) | 
| ヤマイバラ Rosa sambucina Koidz   | 
バラ科  | 
準絶滅危惧(NT) | 
| ヤマゴボウ Phytolacca acinosa  Roxb.  | 
ヤマゴボウ科  | 
情報不足(DD) | 
| ヤマサギソウ Platanthera mandarinorum Rchb.f.  subsp. mandarinorum  var. oreades (Franch. et Sav.) Koidz.  | 
ラン科  | 
絶滅危惧1B類(EN) | 
| ヤマザトタンポポ Taraxacum arakii Kitam.  | 
キク科  | 
絶滅危惧2類(VU) | 
| ヤマジソ Mosla japonica (Benth. ex Oliv.) Maxim.  | 
シソ科  | 
絶滅危惧1B類(EN) | 
| ヤマゼリ Ostericum sieboldii   (Miq.) Nakai  | 
セリ科  | 
情報不足(DD) | 
| ヤマタイミンガサ Parasenecio yatabei  (Matsum. et Koidz.) H.Koyama  | 
キク科  | 
情報不足(DD) | 
| ヤマタツナミソウ Scutellaria pekinensis Maxim.  var. transitra (Makino) H.Hara  | 
シソ科  | 
絶滅危惧1B類(EN) | 
| ヤマトウミヒルモ Halophila nipponica Uchimura&Fave  | 
トチカガミ科  | 
絶滅危惧2類(VU) | 
| ヤマトキソウ Pogonia minor (Makino) Makino  | 
ラン科  | 
絶滅危惧1B類(EN) | 
| ヤマトボシガラ Festuca japonica Makino  | 
イネ科  | 
絶滅危惧2類(VU) | 
| ヤマトミクリ Sparganium fallax Graebn.  | 
ミクリ科  | 
絶滅危惧1A類(CR) |